Uma das vertentes importantes do trabalho do Sedes é a formação contínua de profissionais através de seus cursos que hoje atendem mais de 1 mil alunos. Formar pessoas capazes de exercer seu trabalho com competência, ética e dignidade é o objetivo do corpo docente do Instituto. Seus cursos de especialização e aperfeiçoamento são dirigidos para o aprimoramento de psicólogos, médicos, pedagogos, assistentes-sociais e outros profissionais de nível superior, em qualquer momento de sua vida profissional. Estes cursos têm sido reproduzidos em outras instituições e universidades marcando assim, um modo de fazer educação sincronizada com as demandas reais do país. Os alunos do Sedes encontram na Clínica o espaço de formação técnica articulada com as questões éticas e políticas do exercício profissional.

Já os cursos de expansão, com duração de aproximadamente três meses, são a porta de entrada para todos aqueles que tenham interesses específicos no desenvolvimento profissional e pessoal. A cada semestre os mais de 30 cursos de expansão se renovam tratando de temas específicos nas áreas da filosofia, educação e saúde mental.